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日本のロングリードシーケンシング市場を動かしているのは何でしょうか。本記事では、国内需要を押し上げている要因と、市場を構成する製品タイプ・用途を整理します。
需要を押し上げている要因
日本におけるロングリードシーケンシングへの需要は、従来のショートリードでは解析が困難だったゲノムの構造変異や反復配列を正確に解読できる点が評価され、特に農業や水産物の品種改良、医薬品開発、そしてがんゲノム医療の分野で急速に高まっています。コスト面では、国内の研究機関や企業が導入しやすい価格帯へと装置や試薬の価格が低下してきた一方で、国が主導するゲノム医療の実用化プロジェクトやAMEDの助成が加速要因となっています。さらに、従来はエラー率の高さが課題でしたが、最近の技術的進歩により精度が大幅に向上し、ショートリードとのハイブリッド解析ではなく単独での使用が現実的になり、ユーザーは解析のスループットやリード長の安定性をより重視するようになってきています。この技術シフトにより、日本人集団に特有の遺伝的多様性を考慮したカスタム解析パイプラインの構築が進み、国産のバイオインフォマティクス企業との協業も活性化しています。
製品タイプ別の内訳
- 単一分子リアルタイムシーケンシング (SMRT)
- ナノポアシーケンシング
タイプごとの特徴
シングルモレリアルタイムシーケンシング（SMRT）は、DNAポリメラーゼが一塩基ずつ取り込む際に放出される蛍光シグナルをリアルタイムで検出し、非常に長いリード（平均10～15キロベース、最大100キロベース以上）を得る技術で、反復配列が多いゲノム領域や、相同性の高い遺伝子ファミリーの正確なアセンブリ、またメチル化などのエピジェネティック修飾の同時検出に特に威力を発揮し、新規ゲノムの完全解読や構造変異の精密同定に不可欠です。一方、ナノポアシーケンシングは、タンパク質の孔（ナノポア）をDNA一本鎖が通過する際に生じるイオン電流の変化を測定し、塩基配列を直接解読する手法で、デバイスが小型で持ち運び可能なため、フィールドでの迅速な病原体検出やアウトブレイク調査、またRNAや修飾塩基の直接解析といったリアルタイムかつポータブルな応用が可能です。
用途別の内訳
- 学術研究
- 臨床研究
- 病院とクリニック
- 製薬/バイオテクノロジーエンティティ
- [その他]
市場に関わる主要企業
- Oxford Nanopore Technologies
- Pacific Biosciences of California
- BaseClear B.V.
- Future Genomics Technologies
- Garvan Institute of Medical Research
- Genome Transcriptome Facility of Bordeaux
- NextOmics
- Takara Bio
- Quantapore
- Stratos Genomics
- MicrobesNG
- Institute of Integrative Biology of the Cell
ロングリードシーケンシング市場レポート
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